率先成立光子刀中心
澄清醫院光子刀治療肝癌聞名遐邇，於1998年11月購進首部光子刀，當初光子刀尚在研發中，只能治療腦癌，三個月後再加裝治療身體癌症的光子刀，澄清醫院「光子刀治療中心」正式成立，擁有世界第一台光子刀。
由於肝癌患者到澄清醫院求診日多，在1999年8月，澄清醫院再提升光子刀的儀器，引進3D順形光子刀，更精準地擊殺肝癌，進而推出BID光子刀，一天兩次有效殺癌，再創台灣最先進的治療肝癌記錄。
2001年9月，澄清醫院再將光子刀升級為IMRT，以「逆運算光子刀」為名，上線服務肝癌患者，完全由電腦來運算光子劑量，自動調整癌腫瘤所需的光子，以不同層次的治療方式，更有效打擊肝癌，降低正常組織的傷害。
治療肝癌推進6D時代
2005年1月澄清醫院全新引進德國「6D光子刀」（Image Guide Radiation Therapy），因具有影像導引功能，擁有即時透視病人內臟腫瘤的能力，並可追蹤呼吸中產生之器官位移，精確定位至3mm，可說已到「如影隨形」的境界，給肝癌栓塞治療失敗的病人帶來新希望。
標靶光子刀的新時代
2009年2月18日澄清醫院新購快活光子刀(RapidArc)，是澄清醫院成立光子刀治療中心以來，進入第五代的儀器更新，號稱「國民肝癌秒殺機」光子刀。
2012年9月澄清醫院新設「標靶光子刀」（TrueBeam STx），不但能在三分鐘內完成放射治療，因精準度極高又可採高劑量治療，大大縮短療程，是目前全世界最先進放射治療儀器中的「勞斯萊斯」，堪稱是「平民的質子治療」。
